FCAEB, desde 2004, atua com incubação de projetos. São três as incubadoras do Grupo Formação:

1. INCUBADORA DE NEGÓCIOS PRODUTIVOS
2. INCUBADORA DE ARTES, MÍDIAS E TECNOLOGIAS
3. INCUBADORA DE ESPORTE E CIDADANIA

Em 2019, a Incubadora de Esporte e Cidadania foi reconhecida pela organização HUNDRED, como uma das cem melhores experiências afins, no mundo.  (https://hundred.org/en/innovations/sports-and-citizenship-incubator#c11224bb )

As Incubadoras do Grupo Formação utilizam a metodologia 3 PI e trabalham a partir dos seguintes passos gerais:

1. SEMINÁRIO DE IDEIAS (aflorando ideias a partir do conhecimento acumulado)
2. ORIENTAÇÃO DE ELABORAÇÃO DE PROJETOS (transformando uma ideia em um projeto)
3. INCUBAÇÃO (iniciando a incubação)
4. PROCESSOS FORMATIVOS (preparando para o negócio)
5. ORIENTAÇÃO DE PLANO DE NEGÓCIOS (organizando o negócio)
6. ACELERAÇÃO
7. PROCESSOS FORMATIVOS (preparando para a produção, gestão, comercialização)
8. SUBSÍDIO / FINCANCIAMENTO
9. DISSEMINAÇÃO DO NEGÓCIO
10. REDES